SARS-CoV-2 S gene

RUO- uso ricerca

Il kit SARS-CoV-2 S gene è un metodo in vitro basato sull'amplificazione mediante RT-PCR della regione di RNA virale – gene S – seguita da sequenziamento NGS. Il kit è utile per l’identificazione dei differenti lineage. Ciascun lineage contiene un gruppo di genomi virali caratterizzati da uno specifico set di mutazioni.

Sono stati definiti diversi lineage (Rambaut et al., 2020) tra cui B.1, B.1.1.1, B.1.1.10, B.1.1.217, B.1.1.241, B.1.1.307, B.1.160, B.1.160.7, B.1.177, B.1.177.7, B.1.221, B.1.258, B.1.367, B.1.1.7 e A, di cui cinque (sottolineati) appartengono a varianti selezionate dal Centro Europeo per la prevenzione e controllo delle malattie (ECDC) come varianti che destano preoccupazione e da monitorare con attenzione, o più precisamente “variants of current concern” (VOC).

Dopo la fase di sequenziamento i campioni sono analizzati in automatico mediante un software dedicato.